El Banco de Ojos es el departamento donde se reciben, procesan, evalúan, conservan y distribuyen tejidos oculares humanos para su posterior aplicación clínica. Se encuentra subordinado a la Vicedirección primera y a la Coordinación Nacional de Trasplante de Órganos y Tejidos. Mantiene interrelación directa con el Servicio de Córnea, con todos los servicios asistenciales y de diagnóstico del centro, entre ellos con Laboratorio clínico y Microbiología, así como con las unidades quirúrgicas, farmacia y almacén e indirectamente con los servicios no asistenciales que le son necesarios. Además mantiene relación con los servicios de Córnea de los centros implantadores de todo el país así como con los hospitales donadores de córnea acreditados para este fin.