Aplicar la política del estado, el gobierno y el MINSAP para la gestión de programas nacionales de investigación, la actividad científica y de docencia de postgrado; así como la prestación de servicios científico-técnicos especializados, incluida la regulación y certificación sanitaria, para contribuir al desarrollo de la higiene, la epidemiología, la microbiología y la nutrición en el país; lograr una estabilidad epidemiológica y un mejoramiento de los indicadores del cuadro de salud; con un uso racional de los recursos y un cumplimiento del plan de ingresos.
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