El Consejo Científico es un órgano colectivo asesor del Decano, que tiene por objetivo propiciar y estimular, de forma sistemática el análisis de temas de interés para el desarrollo científico y tecnológico en la Facultad, así como elaborar recomendaciones sobre la base de las prioridades del desarrollo económico, político y social del país y las directivas y normas trazadas por las instituciones estatales.
Reglamento del Consejo Cientíco de la facultad
Por Resolución Decanal No. 96/2012, se decide instituir el Consejo Científico de la Facultad de Ciencias Medicas Manuel Fajardo, perteneciente a la Universidad de Ciencias Médicas de La Habana, el cual queda constituido, en cuanto a los designados y de oficio, por los compañeros que se relacionan a continuación :
| No | Nombre | Cargo |
| 1 | DrC. Fernando Dominguez Dieppa | Presidente |
| 2 | MSC. Dra. Idania Orama Domínguez | Vicepresidenta |
| 3 | DrC. Olga Esther Infante Pedreira | Secretaria |
| 4 | DrC. Noel Orestes Mederos Curbelo | Jefe Comisión Doctorado |
| 5 | DraC. Mireya Esperanza Berra Socarrás | Jefa Comisión superación profesional |
| 6 | MSc. Lic. Serguei Iglesias Moré | Jefe Comisión proyectos e investigaciones |
| 7 | MSc. Dra. Maite Sánchez Pérez | Jefa Comisión evento publicaciones. |
| 8 | MSc. Dra. Midiala Monagas Docasal | Miembro |
| 9 | MSc. Dra. Rossana Planas Labrada | Miembro |
| 10 | DraC. Dolores T. Cantera Oceguera | Miembro comisión Doctorado |
| 11 | DraC. Irma Rosa López Pérez | Miembro comisión Doctorado |
| 12 | MSc. Dra. Giselle Alonso Crespo | Miembro comisión superación profesional |
| 13 | MSc. Lic. Iliana Rodríguez Cabrera | Miembro comisión superación profesional |
| 14 | MSs. Lic. Olga Paz Figueroa | Miembro comisión superación profesional |
| 15 | DraC. María Elena Faxas García | Miembro comisión Doctorado |
| 16 | DrC. Diana Josefa Herrera Santana | Miembro comisión eventos y publicaciones |
| 17 | MSc. Dr. Luis Hernández García | Miembro comisión superación profesional |
| 18 | DraC. Viviam de la Caridad Ramírez Díaz | Miembro comisión Doctorado |
| 19 | MSc. Dra. Esperanza Martínez Uriarte | Miembro comisión eventos y publicaciones |
| 20 | DrC. Eduardo Garbey Savigne | Miembro comisión Doctorado |
| 21 | MSc. Dr. Alejando Fádragas | Miembro comisión proyectos e investigaciones |
| 22 | DrC. Eduardo Cabrera Rode | Miembro comisión Doctorado |
| 23 | DrC. Margarita Chacón Róger | Miembro comisión proyectos e investigaciones |
| 24 | MSc. Dra. Tania Paula Martínez Pérez | Miembro comisión proyectos e investigaciones |
| 25 | Dra. Juana María Velázquez Cardona | Miembro comisión proyectos e investigaciones |
| 26 | MSc. Dra. Rosa María García Nieblas | Miembro comisión eventos y publicaciones |
| 27 | DrC. Francisco Félix Goyenechea Gutiérrez | Miembro comisión Doctorado |
| 28 | MSc. Ing. Néstor Mena Díaz | Miembro comisión proyectos e investigaciones |
| 29 | MSC. Dr. Adolfo Peña Velázquez | Miembro comisión superación profesional |
| 30 | DrC. Lic. Caridad Dandicourt Thomas | Miembro comisión eventos y publicaciones |
| 31 | MSc. Dra. Ingrid Rodríguez Crespo | Miembro comisión superación profesional |
| 32 | MSc. Dra. Laura García Higueras | Miembro comisión eventos y publicaciones |
| 33 | MSc. Dra. Vilma Fundora Álvarez | Miembro comisión superación profesional |
| 34 | MSc. Lic. Maribel Prida Vazquez | Miembro comisión eventos y publicaciones |
| 35 | DrC. Armando Martínez Pedregal | Miembro comisión Doctorado |
