La organización tendría el encargo fundamental de representar a los universitarios cubanos, acompañarlos en la lucha por sus derechos, contra los oprobios de los gobiernos títeres y las dictaduras de la República Neocolonial.
En cada momento de la historia patria, la FEU abrazó la causa de a independencia de Cuba y ha dado sobradas pruebas a la historia, de lo que puede hacer un estudiantado unido y cohesionado en una lucha común.
Hoy la organización sigue estando a la vanguardia de los principales procesos y transformaciones de la sociedad, lleva en su seno la impronta de los que la forjaron y de los que con su sangre la encumbraron para la posteridad.