- Presidir las sesiones del Premio Anual de la Salud y del Premio al Mérito Científico.
- Coordinar los intereses de las sociedades científicas y del Ministerio de Salud Pública, como órgano de relación entre ambos.
- Dar su visto bueno a la creación de secciones, capítulos y sociedades científicas.
- Aprobar los diplomas y títulos acreditativos de miembros de honor y correspondientes de las sociedades científicas.
- Convocar y dirigir las sesiones que celebren de presidentes de sociedades científicas, reuniones de presidentes de los consejos provinciales y el pleno del Consejo Nacional de Sociedades Científicas.
- Velar por el cumplimiento de la Ley No. 54 sobre las asociaciones científicas.
- Dictar las instrucciones pertinentes sobre el sistema de elaboración y control de normas de disposiciones necesarias para el ejercicio de las funciones del Consejo.
- Custodiar el libro de actas del consejo y los demás documentos. Expedir certificaciones relacionadas con los libros de acta y demás documentos bajo su custodia.
- Ejercer la fiscalización de las actividades y fondos económicos de las sociedades, de acuerdo con las normas establecidas.
