El IPK es desde 1979, por orientación expresa de nuestro presidente, en instalaciones mucho más amplias y modernas, un Centro de Excelencia dedicado no sólo a la Parasitología y la Medicina Tropical, sino a la Microbiología Médica, Infectología y Epidemiología de Enfermedades Transmisibles.
El prestigio alcanzado por el IPK en la formación de recursos humanos y las actividades de investigación le ha permitido conducir además una importante actividad de cooperación técnica con otras instituciones y países, contribuyendo en la formación de más de 53 676 especialistas donde alrededor de 4555 provienen de 89 países de los 5 continentes.
Es por ello que cuenta en su estructura organizativa con las siguientes áreas y departamentos:
Dirección General
- Departamento de Salud, Seguridad y Epidemiología Hospitalaria.
- Departamento de Seguridad y Protección.
- Departamento de Ciencia e Innovación.
Centro de Investigación, Diagnóstico y Referencia
- Departamento de Parasitología.
- Departamento de Control de Vectores.
- Departamento Virología.
- Departamento Bacteriología-Micología.
- Departamento de Medios Diagnósticos y Sistemas Críticos.
- Departamento de Vigilancia e Investigaciones Epidemiológicas.
Centro Hospitalario
- Departamento Registros Médicos.
- Departamento de Enfermería.
- Servicio Cirugía.
- Servicio Terapia.
- Servicios Hospitalización y Ambulatorio.
- Departamento Laboratorio Clínico.
- Departamento Laboratorio Microbiología.
- Departamento Rayos X.
- Departamento Anatomía Patológica.
Centro Hospitalario Sucre
- Subdirector Administrativo
- Departamento Enfermería.
Subdirector
- Departamento Transporte.
- Departamento Servicios Generales.
- Departamento Cocina-Comedor.
- Departamento Gestión de Compras y Almacenes.
- Departamento Gestión Capital Humano.
- Departamento Mantenimiento y Sistemas Ingenieros.
Departamento de Docencia
- Sección Información Científico Técnica e Informática.
Departamento Económico
- Sección Gestión Contable
- Sección Gestión Financiera.