Departamento de Bacteriología/Micología-Instituto Pedro Kourí

Responsable de la vigilancia de laboratorio de las enfermedades bacterianas y micóticas, de la validación de vacunas de uso en humanos, y de la producción de kits diagnósticos.

Realiza actividades de referencia regional principalmente en aspectos relacionados a Tuberculosis; brindando además adiestramientos, cursos y asesorías a cubanos y latinoamericanos. Recibe además alumnos de centros tecnológicos, universitarios y postgraduados que se vinculan a investigaciones y desarrollo de tesis para diplomarse en diferentes categorías.

También desarrolla proyectos de investigación multidisciplinaria en colaboración con diferentes centros del país, de la región y el mundo.

Este Departamento está integrado por los siguientes Laboratorios:

Laboratorio Nacional de Referencia e Investigación en Tuberculosis y otras Mycobacterias
Laboratorio Nacional de Referencia en Enfermedades Diarreicas Agudas Bacterianas
Laboratorio Nacional de Referencia en Infecciones Respiratorias Agudas Bacterianas
Laboratorio Nacional de Referencia en Neisserias Patógenas
Laboratorio Nacional de Referencia en Espiroquetas
Laboratorio Nacional de Referencia de Micoplasmas
Laboratorio de Micología Médica
Laboratorio de Biología Molecular

Laboratorio Nacional de Referencia e Investigaciones en Tuberculosis y otras Micobacterias

Perfiles de Trabajo

Prestación de servicios de diagnóstico bacteriológico y serológico al Hospital del IPK, Sanatorios para pacientes infectados con VIH del país y otros hospitales de la capital.
Vigilancia de la resistencia de M. tuberculosis en el país. Forma parte del programa mundial de vigilancia de resistencia de M. tuberculosis en coordinación con la OMS.
Identificación de Micobacterias no tuberculosas.
Aplicación de técnicas de cromatografía: TLC, HPTLC y Gaseosa.
Aplicación de técnicas moleculares en el diagnóstico y epidemiología molecular. PCR, DRE-PCR, RFLP y Spoligotyping.

Referencia

Control de calidad indirecta y directa de la baciloscopía y cultivo de los laboratorios que conforman la red nacional de laboratorios diagnósticos de Tuberculosis.
Actúa como Centro de Referencia para el control de calidad de la baciloscopía, cultivos y pruebas de resistencia de M. tuberculosis de los países de la región.
Identificación de cepas de micobacterias no tuberculosas.

Docencia

Organiza cursos de entrenamiento y actualización, administración de programas de control y talleres de diagnóstico para micobacteriólogos de la red nacional de laboratorios y de países de la región.
Participa en la formación de Médicos residentes en Bacteriología-Micología, Infectología, Inmunología y Epidemiología. Así como de estudiantes de maestrías en estas especialidades.
Prepara entrenamientos a solicitud en los perfiles que se desarrollan en el laboratorio, con duración de dos semanas a un año.

Investigación

Realiza investigaciones encaminadas a la obtención de una vacuna contra la Lepra y la Tuberculosis.
Caracterización de cepas y especies de micobacterias por cromatografía.
Tipaje de cepas de M. tuberculosis aisladas de brotes mediante técnicas moleculares, DRE-PCR, Mixer-Linker-PCR, RFLP y Spoligotyping; se realizan comparaciones entre estas técnicas.
Introducción de técnicas basadas en PCR para la identificación de cepas resistentes de M. tuberculosis.

Laboratorio Nacional de Referencia en Enfermedades Diarreicas Agudas Bacterianas

Entre las labores que realiza el Laboratorio Nacional de Referencia de las Enfermedades Diarreicas Agudas Bacterianas se encuentran:

Referencia de bacterias enteropatógenas recibidas de los CPHE del país: entre otras podemos citar: Género Salmonella, Shigella, E. coli, Vibrio cholerae NO-O1, Aeromonas y Plesiomonas.

Vigilancia de la susceptibilidad antimicrobiana en bacterias enteropatógenas.

Determinación de factores de virulencia: toxinas, proteína de membrana externa, actividad hemolítica y enterotóxica.

Ensayos clínicos de un candidato vacunal contra el cólera.

Caracterización molecular de Salmonella, Shigella y Vibrio, empleando las técnicas de determinación del perfil plasmídico, campo pulsado y AFLP, y RADP-PCR.

Laboratorio Nacional de Referencia en Infecciones Agudas Bacterianas

La tarea fundamental de este laboratorio Nacional es la Vigilancia Microbiológica de las Infecciones Respiratorias Agudas Bacterianas en el país. Para llevarla a cabo, cumple con objetivos tales como: el diagnóstico microbiológico de estas afecciones, el conocimiento de los agentes bacterianos más frecuentes de las IRA y la caracterización de cepas aisladas, y el estudio de la variación de los patrones de resistencia.

Por otra parte, estudia los portadores nasofaríngeos de los agentes bacterianos causales de IRA (Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Staphylococcus aureus) y la similitud de sus patrones de resistencia y genéticos con las cepas invasivas aisladas de afecciones graves.

En el presente el laboratorio se encuentra enfrascado en labores tales como:

Determinación de la frecuencia de circulación de Haemophilus influenzae, Streptococcus pneumoniae y Streptococcus beta hemolíticos.

Caracterización de los patrones de serotipaje, biotipaje y subtipaje en las cepas de Haemophilus influenzae b (serotipo b, biotipos I y II, subtipos 18L-2L) y de Streptococcus pneumoniae.

Estudio de la prevalencia de portadores nasofaríngeos de Hib y Spn en niños menores de 5 años en La Habana.

Estudio de la susceptibilidad antimicrobiana en cepas de Streptococcus pneumoniae y Haemophilus influenzae aisladas de portadores nasofaríngeos y de infecciones invasivas en niños menores de 5 años.

Caracterización de cepas de Streptococcus pneumoniae mediante técnicas de avanzada.

Determinación de los agentes etiológicos más frecuentes causales de IRAB en pacientes inmunodeprimidos.

Tareas de Producción

Elaboración de una variante de omnisuero para el diagnóstico de Streptococcus pneumoniae de acuerdo a los tipos circulantes más frecuentes en Cuba.

Utilización de inmunoglobulinas para la elaboración de reactivos de látex que se encuentran en fase de prueba en varios hospitales pediátricos de Ciudad Habana.

Caracterización de cepas de Streptococcus beta hemolíticos aislados de IRA .

Caracterización de cepas de Streptococcus beta hemolíticos del grupo B por técnicas convencionales y  de Biología Molecular.

Elaboración de antígenos y antisueros para Haemophilus influenzae, Streptococcus pneumoniae y Streptococcus beta hemolíticos.

Elaboración de un lote de 200 kits de látex para el diagnóstico rápido de Haemophilus influenzae tipo b y Streptococcus beta hemolítico grupo B.

Suplemento de crecimiento para el cultivo de los agentes más frecuentes causales de IRA. Medio de Transporte y Conservación para gérmenes fastidiosos.

Este medio es una patente cubana y permite la conservación de cepas de Haemophilus, Neumococcus, Neisserias, etc., a temperatura ambiente por largos períodos de tiempo.

Tareas Docentes

El personal del laboratorio no sólo recibe cursos y entrenamientos, sino que además participa en las actividades docentes del IPK. Imparte clases en las especialidades de Microbiología e Inmunología dentro de los cursos de Residencia y Maestría dentro del programa docente de la institución, tanto a profesionales cubanos como extranjeros.

Igualmente, asumen el papel de tutores y asesores de tesis elaboradas en su laboratorio, tanto por estudiantes universitarios como por especialistas.

Laboratorio Nacional de Referencia en Neisserias Patógenas

El Laboratorio contribuye a la vigilancia de la Enfermedad Meningocócica y Gonocócica en Cuba.

Se realiza la caracterización tanto fenotípica como genotípica de las cepas de Neisseria meningitidis y  Neisseria gonorrhoeae que se reciben desde las diferentes provincias del país. Gracias a ello, se cuenta con información sobre la susceptibilidad a los antimicrobianos recomendados actualmente en el tratamiento de las infecciones producidas por estos microorganismos.

Se lleva a cabo la vigilancia de la frecuencia, la tendencia y la evolución de los marcadores antigénicos de las cepas, y se sigue el comportamiento genético en poblaciones bacterianas, mediante el empleo de métodos contemporáneos de caracterización; esto ha permitido conocer o identificar el grupo principal de la transmisión de la enfermedad y la diseminación de la resistencia a determinados antimicrobianos.

Por otra parte, participa en la evaluación de la capacidad inmunogénica de candidatos vacunales y vacunas combinadas, y de la actividad bactericida del suero en individuos vacunados.

Todo esto ha permitido, entre otras cosas, poner de manifiesto cuál es y cuál puede ser la labor de un Laboratorio de Referencia en el seguimiento y control de la gonorrea y la enfermedad invasiva meningocócica.

Laboratorio Nacional de Referencia en Espiroquetas

El Laboratorio de Espiroquetas del Instituto de Medina Tropical “Pedro Kourí” funciona como Laboratorio Nacional de Referencia para la vigilancia microbiológica de Leptospirosis, Sífilis y Enfermedad de Lyme en la Red Nacional de Salud.

Las actividades que realiza este laboratorio están vinculadas al diagnóstico, la investigaciones y la docencia.

En el diagnóstico se emplean técnicas convencionales de referencia y de avanzada, donde se incluyen tecnologías de ADN y juegos de diagnósticos comerciales.

Las investigaciones están vinculadas, principalmente, con el perfeccionamiento de métodos de diagnóstico, estudios sobre los agentes etiológicos de estas enfermedades y evaluaciones de preparados vacunales producidos en Cuba.

En la docencia se imparten cursos teórico-práctico incluidos en los programas de Maestrías de Bacteriología-Micología, Epidemiología e Infectología, se realizan tutorías de Tesis de Pre-Grado y Post-Grado, y cursos de actualización sobre diferentes temas relacionados con las enfermedades causadas por estos agentes.

Laboratorio de Micoplasmas

El Laboratorio de Micoplasma del Instituto de Medina Tropical “Pedro Kourí” funciona como Laboratorio Nacional de Referencia para la vigilancia microbiológica de enfermedades causadas por micoplasmas, e infecciones en cultivos de células.

Las actividades realizadas en este laboratorio incluyen la investigación, el diagnóstico y la docencia. En investigación se realizan estudios sobre la relación de estos microorganismos con las enfermedades del tracto respiratorio y urogenital en pacientes inmucompetentes e inmunodeprimidos (VIH/SIDA).

En el diagnóstico se emplean técnicas convencionales de referencia y de avanzada, donde se incluyen tecnologías de ADN y juegos de diagnósticos comerciales.

En la docencia se imparten cursos teórico-práctico incluidos en los programas de Maestrías de Bacteriología-Micología, Epidemiología e Infectología; igualmente, se realizan tutorías de Tesis de Pre-Grado y Post-Grado, y cursos de actualización sobre diferentes temas relacionados con las enfermedades causadas por estos agentes.

Laboratorio de Micología Médica

El Laboratorio de Micología del IPK cumple tres funciones básicas: Servicio Diagnóstico, Docencia e Investigación.

El servicio diagnóstico esta principalmente relacionado a las micosis oportunistas en el curso del SIDA (Candidiasis, Criptococosis e Histoplasmosis), por ser ese grupo de pacientes el que se atiende regularmente en nuestra institución.

Se brinda docencia de pregrado y postgrado a estudiantes de la Facultad de Biología de la Universidad de la Habana, Maestría en Bacteriología Micología y Residentes de Microbiología principalmente.

En la investigación (principal función de nuestro laboratorio) trabajamos en estos momentos en:

Cripcococosis:

Estudio de caracterización de cepas aisladas de pacientes (variedad y serotipo) y en la obtención de cepas ambientales para su ulterior caracterización.

Estudio del poder patógeno y de diseminación de diferentes cepas de C. neoformans serotipo A en un modelo murino (UFC/g órgano, histopatología y DL50) para seleccionar cepas de reto.

Obtención y purificación del GXM (serotipo A) para su ulterior conjugación.

Obtención de monoclonales anti GXM (serotipo A) .

Perfeccionamiento de los medios diagnósticos que actualmente se utilizan en el laboratorio (ELISA y Látex).

Se proyectan:

Estudios de protección con un “inmunógeno” conjugado GXM-proteína y con anticuerpos monoclonales (en un modelo murino contra reto controlado)

Candidiasis: (En colaboración con el área de asistencia médica se trabaja en):

El estudio de candidiasis oral y esofágica en pacientes VIH+ y en pacientes SIDA.

Histoplasmosis:

Estudios relacionados con brotes, generalmente asociados con la entrada a cuevas, para intentar el aislamiento de Histoplasma capsulatum del medio ambiente.

Estudios con antifúngicos:

Se han realizado estudios para establecer la CMI de diferentes antifúngicos frente a aislamientos de Candida albicans, otras especies de Candida y C. neoformans. Hasta el presente se ha trabajado principalmente con el medio Casitone y siguiendo la metodología del Instituto Pasteur. En la actualidad se trabaja en la estandarización del método según las normas del NCCLS (documento M27A).

Se trabaja en la normalización de un método para la dosificación de los diferentes antifúngicos (especialmente Anfotericina B) en muestras de pacientes con este tipo de tratamiento.

Principales intereses:

Introducir en nuestro laboratorio métodos moleculares para la tipificación de aislamientos de C. neoformans y especies de Candida y posteriormente su aplicación en la tipificación de aislamientos de Histoplasma.

Consolidar el método para los estudios de sensibilidad y desarrollar estudios de correlación de la respuesta clínica con los resultados de las pruebas “in vitro”.