La microbiología es la ciencia encargada de determinar el agente causal de la patología en enfermedades infecciosas. Independientemente si es causada por una bacteria, un virus, hongos o parásitos, tiene como objetivos fundamentales el diagnóstico y pronóstico, seguimiento y tratamiento de enfermedades, así como la divulgación de la salud, vigilancia epidemiológica de la comunidad y del país en general. En el laboratorio se realizan determinaciones como: exudados vaginales con cultivo, endocervicales, exudados uretrales de mujer, test de Clamidia, test de Micoplasma, VDRL para Sífilis, VIH, test de Toxoplasma, Urocultivos, entre otros que son de vital importancia en la atención y cuidado de gestantes, pacientes de reproducción asistida, patología de cuello, y otras consultas que brinda el Hospital, garantizando una mejor calidad de vida de nuestra población, acudir a tiempo aumenta la posibilidad de un diagnóstico rápido así como un tratamiento eficaz; en el Hospital Materno la microbiología juega un papel importante que refuerza el programa de Atención Materno Infantil (PAMI), brindando una atención a las gestantes mediante los seguimientos que indican sus médicos durante los tres trimestres de gestación, así como a los neonatos hospitalizados en la institución. Brindar un servicio de calidad a los pacientes es y será siempre el camino y la meta de todo el personal que aquí labora.